One of unusual and most intriguing feature of heavily mutated Omicron variant is that it acquired all the mutations in a single burst in a very short span of time. The degree of change is so much so that some people think it could well be a new strain of human կորոնավիրուսի (SARS-CoV-3 ?). How such a high level of mutation may have occurred in such a short span? Some argue that Omicron may have evolved from an immune suppressed patient with some chronic infection like HIV/AIDS. Or, could it have evolved in the current wave in Եվրոպա which has witnessed very high transmission rates? Or, could it be associated with some Gain-of function (GoF) research or anything else? Who benefits? It is not possible to draw any conclusion at this stage. Nevertheless, this article attempts to throw light on various dimensions associated with the phenomenon.
Վերջերս հաղորդված նոր COVID-19 տարբերակը Հարավային Աֆրիկայից 25-ինth 2021 թվականի նոյեմբերը տարածվել է աշխարհի մի շարք երկրներում՝ Մեծ Բրիտանիա, Կանադա, Ճապոնիա, Ավստրալիա, Ավստրիա, Հոնկոնգ, Իսրայել, Իսպանիա, Բելգիա, Դանիա և Պորտուգալիա: Սա ԱՀԿ-ի կողմից նշանակվել է որպես մտահոգության նոր տարբերակ (VOC) և անվանվել Omicron. Omicron-ը բնութագրվում է ամինաթթուների 30 փոփոխություններով, երեք փոքր ջնջումներով և մեկ փոքր ներդիրով հասկի սպիտակուցի մեջ՝ համեմատած սկզբնական վիրուսի հետ։1. Այնուամենայնիվ, հիմնվելով մուտացիայի տեմպերի վրա2 ՌՆԹ վիրուսների դեպքում հնարավոր չէ մեկ գիշերվա ընթացքում զարգացնել 30 գումարած մուտացիաներ: Առնվազն 3-ից 5 ամիս կպահանջվի SARS-CoV-6-ի 30 կբ գենոմում 2 մուտացիա առաջացնելու համար՝ հիմնված այն մուտացիայի արագության վրա, որը վիրուսը ենթարկվում է բնական ճանապարհով:2 հյուրընկալողից հյուրընկալող փոխանցվելուց հետո: Այս հաշվարկով պետք է 15-25 ամիս պահանջվեր Omicron-ի նման մի բանի առաջացման համար, որը կրում է 30 մուտացիա: Այնուամենայնիվ, աշխարհը չի տեսել այս աստիճանական մուտացիայի աճը նշված ժամանակահատվածում: Ենթադրվում է, որ այս տարբերակն առաջացել է իմունային անբավարարված հիվանդի քրոնիկական վարակից, հնարավոր է` ՄԻԱՎ/ՁԻԱՀ-ով չբուժված հիվանդի: Ելնելով փոփոխության աստիճանից՝ այն պետք է դասակարգվի որպես վիրուսի նոր շտամ (SARS-CoV-3 կարող է լինել): Այնուամենայնիվ, առկա մուտացիաների թիվը կարող է վկայել դրա ավելի բարձր փոխանցելիության մասին, քան մյուս տարբերակները: Այնուամենայնիվ, դա հաստատելու համար ավելի շատ ուսումնասիրություններ են պահանջվում:
Հաջորդ մի քանի շաբաթները կարևոր են նոր տարբերակի փոխանցելիությունը և դրա պատճառած հիվանդության ծանրությունը որոշելու համար: Մինչ այժմ բոլոր դեպքերը եղել են թեթև և առանց ախտանիշների, և լավ նորությունն այն է, որ մահացություն չի եղել։ Մենք նաև պետք է գնահատենք, թե որքանով է նոր տարբերակը կարող խուսափել իմունային պաշտպանությունից, որն ապահովում են ներկայիս պատվաստանյութերը: Սա մեզ թույլ կտա որոշել, թե որքան ժամանակ կարող ենք շարունակել ներկայիս պատվաստանյութերը՝ նախքան դրանք նոր տարբերակի համար հարմարեցնելը: Pfizer-ը և Moderna-ն արդեն քայլեր են ձեռնարկել իրենց պատվաստանյութերը շտկելու ուղղությամբ: Այնուամենայնիվ, այս տարբերակի ծագման մասին դեռևս մնում է մոլեգնող հարցը: Հավանական է, որ Omicron տարբերակը կարող էր զարգացած լինել Եվրոպայում դեպքերի ավելի բարձր հաճախականության ներկայիս ալիքում շատ ավելի վաղ, բայց վերջերս հաղորդվել էր Հարավային Աֆրիկայի իշխանությունների կողմից (հիմնվելով գենոմի հաջորդականության վրա): Այնուամենայնիվ, դա կարող է այդպես չլինել, քանի որ ընթացիկ ալիքը եղել է վերջին 4-5 ամիսների ընթացքում և, ըստ մուտացիայի տեմպերի, պետք է հանգեցներ ոչ ավելի, քան 5-6 մուտացիաների:
Or was Omicron, a product of Gain of Function (GoF) research leading to development of pandemic potential pathogens (PPPs)3,4. Ֆունկցիայի ձեռքբերումը վերաբերում է փորձերին, որոնցում պաթոգենը (այս դեպքում՝ SARS-CoV-2) ձեռք է բերում այնպիսի ֆունկցիա կատարելու ունակություն, որն այլապես իր կանոնավոր գոյության մաս չէր: Այս դեպքում դա կարող է հանգեցնել փոխանցելիության բարձրացման և վիրուսայնության բարձրացման: Սա կարող է հանգեցնել այնպիսի օրգանիզմի զարգացմանը, որը նոր է և գոյություն չի ունեցել բնության մեջ: GoF-ի հետազոտության նպատակն է հասկանալ պաթոգեն տարբերակները և պատրաստ լինել թերապևտիկ կամ պատվաստանյութին, եթե նման տարբերակ առաջանա բնության մեջ: ՊՄԳ-ների կողմից ձեռք բերված մուտացիաների քանակը ոչ միայն դարձնում է շտամը խիստ փոխանցելի, այլև օգնում է խուսափել ապաքինվող անհատների մոտ սկզբնական վիրուսի դեմ ստեղծված չեզոքացնող հակամարմիններից: Բացի այդ, շտամների մանիպուլյացիան հնարավոր է օգտագործելով գենետիկական ինժեներիայի ժամանակակից մեթոդները, որոնք հիմնված են թիրախային ՌՆԹ-ի վերահամակցման վրա:5. Սա կարող է նաև հանգեցնել նոր պաթոգեն տարբերակների/շտամների՝ ավելի մեծ թվով մուտացիաներով, ինչը կհանգեցնի խիստ փոխանցվող և վարակիչ վիրուսի: Հետազոտությունները ցույց են տվել, որ հասկի սպիտակուցի 20 մուտացիաները, ներառյալ փոփոխություններն ու ջնջումները, բավարար են SARS-CoV-2-ով վարակված կամ դեմ պատվաստված անհատների պլազմայում առաջացած հակամարմինների մեծամասնությունից խուսափելու համար:6. Համաձայն մեկ այլ հետազոտության՝ ուժեղ իմունային ճնշման տակ SARS-CoV-2-ը կարող է ձեռք բերել հակամարմիններից փախչելու ունակություն՝ կատարելով ընդամենը 3 փոփոխություն՝ երկու ջնջում N տերմինալ տիրույթում և մեկ մուտացիա (E483K) հասկի սպիտակուցում։7.
Արդյո՞ք պետք է թույլ տալ նման հետազոտություններ, որոնք կհանգեցնեն ՊՄԳ-երի արտադրությանը: Փաստորեն, ֆունկցիոնալ հետազոտությունների ձեռքբերումն արգելվել է ԱՄՆ-ի կողմից 2014թ.-ին NIH-ի կողմից՝ ԱՄՆ Հիվանդությունների վերահսկման և կանխարգելման կենտրոններում սխալ կիրառված պաթոգենների հետ կապված մի շարք դժբախտ պատահարներից հետո, ինչը ենթադրում է, որ նման տեսակի հետազոտությունների հետ կապված ռիսկերը շատ ավելին են: օգուտները, որոնք այն կարող է ապահովել: Ո՞ւմ է ձեռնտու նման ՊՄԳ-ների առաջացումն ու տարածումը։ Սրանք կոշտ հարցեր են, որոնք իրական պատասխաններ են պահանջում:
***
Հիշատակում:
- Հիվանդությունների կանխարգելման և վերահսկման եվրոպական կենտրոն. SARSCoV-2-ի առաջացման և տարածման հետևանքները B.1.1. 529 մտահոգության տարբերակ (Omicron), ԵՄ/ԵՏԱ-ի համար: 26 նոյեմբերի 2021թ. ECDC. Ստոկհոլմ; 2021. Հասանելի է առցանց՝ հասցեով https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529
- Սիմոնդս Պ., 2020. Սանձարձակ C→U հիպերմուտացիա SARS-CoV-2-ի և այլ կորոնավիրուսների գենոմներում. պատճառներն ու հետևանքները նրանց կարճ և երկարաժամկետ էվոլյուցիոն հետագծերի համար: 24 հունիսի 2020թ. DOI: https://doi.org/10.1128/mSphere.00408-20
- NIH. Հետազոտություն, որը ներառում է ուժեղացված պոտենցիալ համաճարակի պաթոգեններ: (էջը վերանայվել է 20 թվականի հոկտեմբերի 2021-ին։ https://www.nih.gov/news-events/research-involving-potential-pandemic-pathogens
- «Գործառույթի ձեռքբերում» հետազոտության փոփոխվող ավազները: Nature 598, 554-557 (2021): doi: https://doi.org/10.1038/d41586-021-02903-x
- Բերտ Յան Հայժեման, Հաուկելիեն Վոլդերսը և Փիթեր Ջ.Մ. Ռոտիերը: Տրոպիզմի տեսակների փոխարկում. կատվային կորոնավիրուսի գենոմի մանիպուլյացիայի արդյունավետ միջոց: Վիրուսաբանության ամսագիր. Հատ. 77, No 8. DOI: https://doi.org/10.1128/JVI.77.8.4528-4538.20033
- Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Բարձր գենետիկ խոչընդոտ SARS-CoV-2 պոլիկլոնալ չեզոքացնող հակամարմինների փախուստի համար: Բնություն (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0
- Անդրեանո Է., et al 2021. SARS-CoV-2-ի փախուստը խիստ չեզոքացնող COVID-19 ապաքինող պլազմայից: PNAS սեպտեմբերի 7, 2021 118 (36) e2103154118; https://doi.org/10.1073/pnas.2103154118
***
